
弗朗西斯克里克研究所的科学家们已经将所有可能的变化结果映射到一种叫做VHL这是一项大规模研究项目的第一步,旨在揭开谜底基因1中成千上万的遗传变异的结果与癌症有关。
临床医生可能会发现,使用这种VHL地图更容易识别患肾癌风险较高的患者,或者对特定药物的反应更好。
一个或多个DNA构建块的变化会导致遗传变异或变化。获得或遗传的VHL基因变异会增加患肾癌的风险。然而,许多人在不了解其癌症风险的情况下,在VHL中被诊断为“意义未知的变异”。
克里克大学的研究人员使用了一种称为饱和基因组编辑的新技术来监测人类细胞中2000多种不同VHL变体的功能。这项研究发表在《自然遗传学》杂志上。
每个VHL变体根据存活细胞的数量被分配一个“功能评分”;分数越低,这种变异就越危险。
大多数被检测的VHL变异对细胞的存活能力没有影响,这表明这些变异的携带者可能不会明显增加风险。另一方面,一些变异是第一次被发现有缺陷的,这意味着携带这些变异的患者现在可以进行常规筛查,以降低患癌症的风险。
在最危险的版本中,细胞死亡。研究人员发现,有缺陷的VHL基因提高了HIF基因的活性。虽然过量的HIF蛋白会导致肿瘤,但这种基因是细胞在低氧环境中生存所必需的。
当HIF被移除时,携带这些VHL突变的细胞能够存活,这表明HIF对于VHL的有害影响是必要的。
只有那些具有影响细胞中HIF数量的突变的人才能从抑制HIF蛋白的药物贝祖替芬中获益。根据克里克团队的评分系统,贝尔祖替芬治疗可能对VHL突变患者有益。
当研究人员最终将他们的评分系统与向公众开放的肾癌数据库进行比较时,他们发现他们的方法可以100%准确地预测以前在诊所发现的致癌变异。
该研究的第一作者、剑桥大学现任博士生梅根·巴克利说:“通过微调饱和基因组编辑方法,我们已经证明,一种相对简单的测试可以识别不同的VHL突变在人类细胞中的作用。令人惊讶的是,许多可能与癌症相关的变异在这项测试中得分为中性,这表明该评分系统可以让处于不确定状态的患者清楚他们的VHL诊断意味着什么。”
为了监测功能评分如何预测VHL突变患者的肿瘤生长和治疗反应,该实验室目前正在与克里克大学的癌症动力学实验室合作。
为了绘制出15个额外的癌症风险基因的所有变异效应,他们还与伦敦的威康桑格研究所和癌症研究所合作。











